Über Millers Familie und Herkunft ist nichts bekannt. Er studierte von 1801 bis 1803 an der Universität Innsbruck Philosophie, praktische Mathematik und Forstwissenschaft. 1809 erhielt er eine Anstellung als Oberschreiber am Landgericht Weiler in Bayern, die er schon ein Jahr später wieder aufgab, um 1811 mit den Fabrikanten Johann Baptist König aus Immenstadt und Franz Xaver Baldauf (1764–1850) aus Ebratshofen eine „Leinwandhandels-Sozietät“ in Immenstadt zu gründen. Die Handelsgesellschaft unterhielt Geschäftsbeziehungen zu Produzenten und Tuchhändlern in Deutschland, Italien, Frankreich, den Niederlanden und der Schweiz. Miller, der mehrere Sprachen beherrschte, führte die geschäftliche Korrespondenz und unternahm zahlreiche Geschäftsreisen ins In- und Ausland. Als das Unternehmen 1821 in Konkurs ging, verlor er als einer der Teilhaber sein gesamtes Vermögen.

Einer der Gründe für den unternehmerischen Misserfolg waren die Handels- und Verkehrsbeschränkungen im Deutschen Bund, dessen Mitgliedsstaaten den deutschen Binnenhandel durch zahlreiche Zollgrenzen und Abgaben erheblich belasteten. Dagegen engagierte sich Miller seit 1820 in dem 1819 von Friedrich List (1789–1846) gegründeten „Allgemeinen Deutschen Handels- und Gewerbeverein“ (ADHGV), der in Petitionen und Publikationen die Schaffung eines deutschen Binnenmarkts ohne Zollschranken forderte. Von 1820 bis 1823 war er Vereinsbevollmächtigter bei den in Darmstadt von den deutschen Mittel- und Kleinstaaten geführten Verhandlungen über ein gemeinsames Zoll- und Handelssystem, die nicht zum gewünschten Erfolg führten. Miller wurde indessen 1823 zum Steuerrat im württembergischen Finanzministerium berufen und setzte sich in dieser Funktion in den folgenden Jahren energisch für die innerdeutsche Zoll- und Handelseinheit ein. In wirtschaftspolitischen Schriften und Artikeln in Zeitschriften und Tageszeitungen wie der Augsburger Allgemeinen Zeitung trat er weiterhin für die Abschaffung von innerdeutschen Zöllen und Handelsbeschränkungen ein.

Miller war maßgeblich an den Verhandlungen beteiligt, die 1828 zur Gründung des bayerisch-württembergischen Zollvereins führten, mit dem in Süddeutschland ein großes einheitliches Zollgebiet eingeführt wurde. Von 1828 bis 1834 war er württembergischer Generalbevollmächtigter bei der bayerischen Generalzolladministration in München. Als die süddeutschen Staaten 1834 in den von Preußen geführten Deutschen Zollverein eintraten, wurde der im selben Jahr zum Obersteuerrat beförderte Miller württembergischer Zollvereinsbevollmächtigter bei der Zolldirektion in Darmstadt. Diesen wichtigen Posten übte er bis zu seinem Tod 1842 aus.

Miller gehörte zu den energischsten Vorkämpfern eines einheitlichen Wirtschaftsraums in Deutschland. Als Unternehmer, Lobbyist, Beamter und Publizist setzte er sich seit 1819 für die Schaffung eines einheitlichen deutschen Binnenmarkts ein, auch um Deutschland auf internationaler Ebene wettbewerbsfähiger zu machen.